По всему миру закопанные первые этажи зданий, чем их закапывали, или выкапывали котлованы под подвалы?

Скорее всего вы говорите о культурных слоях. Это толщи деятельности человека на протяжении прошлых лет, веков. Масса факторов способствующих появлению этих слоёв - старые строения, слои проездов, пешеходных путей, насыпей и т.д.. Поэтому постепенно появляются слои которые оставляют под условно землёй нижние этажи. Так же сюда можно включить и процент просадки домов в грунт, это тоже вносит вклад в культурные слои.