Ну лично я так делаю, в тех случаях, когда мне кажется, что ответ не настолько плох, насколько его заминусовали. Иногда бывает, что в ответе просто есть какие-то спорные моменты, но вопрос вышел в топ, получил много просмотров, и нашлось много желающих поставить минус. Это как-то не очень хорошо, особенно, когда у человека всего два-три ответа.
Но вообще я не стесняюсь ставить и минусы, и плюсы, в целом, это правильная и полезная система.