Себестоимость одного изделия сделанного на заказ и время потраченное на его производство выше, чем аналогичного изделия из серийного производства.
Поэтому и стоимость обычно выше. Но не всегда. Частенько в себестоимость компаний, с изделиями серийного производства закладывается огромный бюджет на маркетинг и рекламу, вот тут уже штампованное изделие может стоить в разы дороже.
Потому что в готовой мебели нет отходов, материалы кроятся под ноль. А в мебели на заказ по индивидуальным размерам порой остаются большие отходы ЛДСП, пластика и т.д.