Потому что на большинстве территорий России до сих пор почти никто не живёт. И вряд ли в ближайшее время эти обширные территории будут заселены. Природа пока что не побеждена.
Но если речь только о западной части России с более-менее благосклонным климатом, то сложилось же. Три республики Закавказья (+ несколько непризнанных), Украина, Молдавия, Белоруссия, прибалтийские республики. Все они были частью России и выделились с исторической точки зрения недавно.
При этом надо добавить, что бывшие феодальные княжества тянулись к объединению, как в Европе, так и в России. Другое дело, что европейские молодые национальные государства ограничивались Францией, Германией или Италией, то в России масштаб этого позднефеодального объединения принял невиданные масштабы, плавно перейдя в колонизацию Средней Азии и Сибири. Тут скорее повезло, что эти земли были так близко к границам. Ведь европейские государства вынуждены были для проведения своей колониальной политики расширяться в Африку, Америку, Азию.
Главная причина - низкая заселённость большей части территории. Как результат, если там и образовывались государства, то они были недостаточно сильными для противостояния оккупации со стороны Москвы.