Добрый день!
Может, потому, что сын не убивал Павла I, хотя несомненно о заговоре знал и ему не препятствовал, и это не было таким уж ключевым событием для Толстого. Убийство Павла I было последним классическим дворцовым переворотом в нашей истории, но его ключевой статус для того времени мне тоже не слишком очевиден.
Удачи вам и спасибо за вопрос. Он интересен.
Тут хотел бы добавить еще один аспект.События 1801 года,связанные с дворцовым переворотом и смертью Павла,цензурировались в России до 1905 года.Нельзя было упоминать сам факт насильственной смерти Павла(официальная версия была апоплексический удар).Так что шансов на издание романа в России 19 века,где более или менее правдиво описывались бы эти события,не было.
Конечно, я согласен с другими ответами, но есть ещё один фактор. Насколько мне известно, Толстой недолюбливал Наполеона. А Павел I заключил с ним мир, в то время, как Европа вела войну с Бонапартом, и даже пошли слухи о грядущем союзе и ведении совместной войны против Великобритании. Скорее всего сам Лев Николаевич не одобрял этот союз.