Сотрудникам ФСБ присваиваются воинские звания в соответствии с Федеральным законом "о воинской обязанности и военной службе". Специальные звания в МВД, СК, прокуратуре и т. д.
Вообще, как и любое военное подразделение в ВС РФ и в ФСБ в том числе все они являются как силовые организации и у каждого подразделения есть соответствующий номер, который закрепляется за военным подразделением.
Нет, так как ФСБ является одной из нескольких федеральных служб РФ, которые подчиняются президенту, а в этих службах присваиваются специальные звания, потому что у них соответствующие службам полномочия.