Чем отличаются регистрационные документы лодочного прицепа от обычного легкового прицепа?

Ничем не отличаются, если это не грузовой, тут не подскажу, но по логике и у грузового прицепа все тоже самое.

Для регистрации Вы должны либо взять талон в гибд, выдаётся день в день, либо зарегистрироваться через госуслуги и другие порталы и приехать к назначенному времени.

От Вас потребуется предоставить в окно:

1. ПТС, либо выписку электронного ПТС.
2. Договор купли-продажи.
3. Акт приёма-передачи.
4. Паспорт собственника.
5. Квитанцию об оплате они не требуют, но им нужен номер квитанции.
6. Ну и сам прицеп для осмотра.

Какой это прицеп, лодочный или обычный бортовой, роли не играет. Если он до 3500 кг родной массы, они все, по сути, легковые!