Главное различие состоит в используемом боеприпасе: в пистоле-пулемете используются пистолетные патроны(9х19, 45acp, 7.62x25тт и т.д), в автомате винтовочные(7.62х39, 5.56х45, 308win и т.д)
В автомате, вроде, некие "промежуточные", а не винтовочные