Можно ли верить Евангелию от Фомы? Ведь там нет ничего противоречивого и церковь не признала Его лишь по причине позднего появления.

Вы вправе верить хоть в рептилоидов. Свобода вероисповедания, как-никак.

Если же человек соотносит себя с какой-либо церковной (или просто религиозной) деноминацией, то он должен придерживаться взглядов, которые приняты среди адептов этой церкви (религии) и/или не противоречат им.

Если речь идёт о Православном христианстве, то в данном случае «Евангелие от Фомы» не входит в библейский канон и отвергнуто Церковью. Возможно, в нем и есть зерна правды. Однако т.н. Отцы Церкви обнаружили в нем плевелы лжи. И раз последние были обнаружены в некотором количестве, а количество их неизвестно, то и весь текст (и зерна, и плевелы) был объявлен неканоническим. Чуть подробнее можно почитать на этой страничке.

Иными словами, там таки есть что-то противоречивое, верить «Евангелию Фомы» православному христианину нельзя.

То же касается и других неканонический книг

Нет, это гностическая подделка и конечно её не признали не только, потому что она поздно появилась. Об этой подделке как о тексте гностического круга писали в 230-х годах Ипполит Римский и Ориген. Кирилл Иерусалимский называл его одним из ключевых текстов манихейцев.

Написанием Библии руководил Бог, а не Церковь и если Евангелия от Фомы не вошла в состав Библии, в которой число книг 66, значит она не была вдохновлена святым духом и нет разницы, что там написано

А гдеж ваы его прочитали если церковь его "евангелие " не признало ??? Вы что специалист по евангелиям ??? Что то я сомневаюсь если вы приводите в качестве "доказательств" газетные вырезки ...

Смотря как вы хотите использовать информацию из этого свидетельства: для проповедования каких-то нюансов событий того времени - можно, для математически точного воспроизведения картины и порядка событий - нельзя.