Здравствуйте.Отказ в проведении КМО не правомерен.
В данном случае вам необходимо обжаловать решение путём подачи искового заявления в суд.
В соответствии с п. 7 ст. 28 N 53-ФЗ
• Решение призывной комиссии может быть обжаловано гражданином в установленный законодательством Российской Федерации срок со дня получения гражданином копии указанного решения в призывную комиссию соответствующего субъекта Российской Федерации или в суд.
• Жалоба гражданина должна быть рассмотрена в пятидневный срок со дня ее поступления в призывную комиссию соответствующего субъекта Российской Федерации.
• Реализация решения призывной комиссии приостанавливается до вынесения решения призывной комиссией соответствующего субъекта Российской Федерации или вступления в законную силу решения суда.
Обязательно правильно подготовьте исковое заявление и оповещение военкомата о подачи в суд, чтобы он в свою очередь не объявлял в розыск.
Если будут дополнительные вопросы, пишите.