Здравствуйте.
Если речь идет только о самой плите на глубину не более одного метра, то ни с кем согласовывать это не нужно. Это Ваш дом, Ваша крепость и ы вправе делать с ним все, что вздумается. Естественно это не должно нанести вред несущей способности и прочности фундамента. Т.е., если это отверстие 200-300 мм - бурите и не переживайте.
А вот если глубина более одного метра - тут могут возникнуть проблемы. И в нашей практике такое было. Попадали на: водопровод и кабель спецсвязи. Если дом уже построен это означает, что все разрешительные документы на строительство в данном месте Вы получили. Т.е. под основанием дома нет инженерных коммуникаций. Если такого разрешения у Вас нет - советую сначала пройти все инстанции, а потом бурить.
Удачи Вам и всего доброго.