Если честно, я точного ответа на этот вопрос не знаю, но думаю, что причина в том, что Чехия богаче Словакии и в какой-то момент чехи просто не захотели содержать словаков - не захотели быть их донорами. В принципе это очень похоже, например, на Баварию в Германии: это тоже основная земля - донор. Так вот многие баварцы недовольны, что они (ну и еще пара земель) кормят всю остальную Германию и там довольно сильны сепаратистские настроения. Так вот в Чехословакии в некоторый кризисный момент подобные настроения, видимо, были реализованы в виде распада страны.