Его басни как раз и писались для детей, а потому каждая из них писалась под определенный случай и имела целью научить ребенка чему-то новому, показать как следует поступать, а как поступать не надо.
Можно сказать, что главное отличие этих басен в их возрастной направленности, это собственно уроки, которые записаны на бумаге. Эти басни действительно можно называть притчами.
Вот например басня про Собаку и ее тень. Собака позарилась на чужой кусок и потеряла свой - мораль очевидна, довольствуйся тем что имеешь и не помышляй о чужом.
Следовательно в баснях Толстого есть мораль, она идет как вывод, который должен сделать ребенок, прослушав басню.
А иносказательность конечно есть - та же собака представляет собой иносказательный образ человека, которому захотелось чужого добра.