Тюнер показывает все правильно, просто вы не дотянули струну, тяните еще, после D вы увидите заветную E, это на хроматическом режиме, если поставите в режим гитара, то тяните пока не увидите 1E :)
Никак они и не называются. Басовые таковыми стали исключительно от способа игры. Так уж сложилось, что при игре с переборами струн басовые струны выполняют роль главной ноты.