В современном мире (в особенности на территории России) ислам действительно претерпел значительные изменения, стал не таким радикальным, как в странах ортодоксального ислама (в том числе, и в Саудовской Аравии), практически отсутствует антагонизм между мусульманами и православными христианами.
Автор вопроса спрашивает, почему в С.А. казнят людей за призывы к атеизму. Там казнят и за гораздо более мелкие (с нашей точки зрения) прегрешения. Не будем забывать, что в стране строго исполняются наставления Корана, Сунны, существуют шариатские суды.
Чтобы было более понятно то, о чём идёт речь, представляю читателям следующее:
Это напутствия некоторых аятов (стихов) из 4-х Сур (глав) Корана.
Сура 2, аят 191: Убивайте их (многобожников)(то есть, язычников) , где бы вы их ни встретили, и изгоняйте их оттуда, откуда они вас изгнали. Искушение хуже, чем убийство. Но не сражайтесь с ними у Заповедной мечети (речь идёт о Каабе), пока они не станут сражаться с вами в ней. Если же они станут сражаться с вами, то убивайте их. Таково воздаяние неверующим!
Сура 4, аят 89: Они хотят, чтобы вы стали неверующими, подобно им, и чтобы вы оказались равны. Посему не берите их себе в помощники и друзья, пока они не переселятся на пути Аллаха. Если же они отвернутся, то хватайте их и убивайте, где бы вы их ни обнаружили. Не берите себе из них ни покровителей, ни помощников.
Сура 8, аят 12: Вот твой Господь внушил ангелам: «Я - с вами. Укрепите тех, которые уверовали! Я же вселю ужас в сердца тех, которые не веруют. Рубите им головы и рубите им все пальцы».
Сура 8, аят 39: Сражайтесь с ними, пока не исчезнет искушение и пока религия (поклонение) не будет полностью посвящена Аллаху. Если же они прекратят, то ведь Аллах видит то, что они совершают.
Сура 9, аят 5: Когда же завершатся запретные месяцы, то убивайте многобожников, где бы вы их ни обнаружили, берите их в плен, осаждайте их и устраивайте для них любую засаду. Если же они раскаются и станут совершать намаз и выплачивать закят (церковный налог), то отпустите их, ибо Аллах - Прощающий, Милосердный.
Сура 9, аят 29: Сражайтесь с теми из людей Писания (речь идёт о христианах), которые не веруют ни в Аллаха, ни в Последний день, которые не считают запретным то, что запретили Аллах и Его Посланник, которые не исповедуют истинную религию, пока они не станут собственноручно платить дань, оставаясь униженными.
Сура 9, аят 73: О, Пророк! Борись с неверующими и лицемерами и будь суров к ним. Их пристанищем будет Геенна. Как же скверно это место прибытия!
Ещё раз напомню, что С.А. – страна ортодоксального ислама. Поэтому слова из Корана, переданные мусульманам пророком Мухаммедом, воспринимаются там, как истина в последней инстанции. И ООН для этого государства в плане исполнения религиозных догм - дело десятое.
А Вы спрашиваете, почему там так жестоко обращаются с атеистами?!