Современные исследования показывают, что вторичноротые и первичноротые, составляющие кладу Nephrozoa, вместе произошли от примитивных двусторонне симметричных животных. Первые вторичноротые появились в начале кембрийского периода. У вторичноротых в период зародышевого развития на месте первичного рта (бластопора) образуется анальное отверстие, а собственно рот независимо появляется в передней части тела. Есть вторичная полость тела (целом). У большинства (хотя известно множество исключений) первичноротых билатерий бластопор превращается в ротовое отверстие либо закрывается. У вторичноротых превращается в анус. Рот образуется на противоположном (анимальном) полушарии эмбриона, где архентерон приходит в соприкосновение с эктодермой. Вторичноротость встречается в семи совершенно разных типах «первичноротых» (Protostomia). Она возникла в этих группах самостоятельно, независимо от эволюционной ветви «вторичноротых». Вторичноротость — простой и удобный способ формирования кишечника, не требующий никаких сложных изгибов и смещений зародышевых зачатков. Этот способ возникал во многих группах животных. Это пример эффекта рационализации развития. Разные ветви животных независимо «изобретают» тот способ развития является самым экономичным.