Да, ваша мама может использовать своё право на имущественный вычет за покупку квартиры в качестве уменьшения налога от продажи.
Еще уменьшить налог можно на покупную сумму, за сколько была куплена эта проданная квартира.
При покупке квартиры на ваше имя, платежные документы тоже должны быть на ваше имя, чтобы вы в дальнейшем могли получить вычет.