Это слово имеет для вас негативную коннотацию? Для меня нет, ведь есть научные проблемы, а определение слова: "вопрос, требующий решения" А по каким критериям определяется, требует ли вопрос решения?
У большинства людей научные проблемы ничего не требуют, являются ли они проблемами?
А если решение вопроса принесёт пользу, но он не стучит кулаком по столу, он является проблемой?