Добрый день, Андрей.
Если был нанесен такой урон, что здание признают аварийным и его придется сносить, то да, стоимость снизится, т.к. здание будет снесено, и его стоимость будет равна нулю.
В остальных случаях лучше заказать независимую оценку и сделать необходимые операции по оформлению, пока стоимость не упала.