Вы предложили тему для достаточно дорогостоящего исследования.
Что у нас есть? У нас есть "центральные" географические локации - Спарта и Македония. У нас есть карты военных походов. Александра Македонского. Того же Пирра Эпирского (в Италию и не только). Мы знаем географию поисков. Там, среди издревле местного населения - можно и поискать ваши гапло-группы. Причём, они должны быть не просто общими для этих мест, они должны быть ещё и близкими к грекам, греческими по происхождению. Дело может и небезнадёжное, но архисложное, ИМХО.