Сначала проверьте качество основания. Если оно неровное, то волны не исчезнут.
Кроме того, если волны возникли но линолеуме, где уже стоит мебель, то, вероятно, из-за неравномерности давлений возникают перепады уровня покрытия.
Попробуйте убрать мебель и разгладить прижимным роликом линолеум до каждого из краёв.