Надо ли начислять НДС на зарплату?

Зарплата сама по себе не является добавленной стоимостью. Таковой она становится (чисто экономически) при включении ее в расходы текущего периода, в котором есть реализация товаров (работ или услуг).

Ведь налоговая база по НДС - это разница между стоимостью реализованных товаров (работ или услуг) и приобретенных товаров (работ или услуг).

Таким образом, если сумма зарплаты работников включена в отчетном периоде в стоимость реализованных товаров (работ или услуг), то она составляет часть "добавленной стоимости", и в этом (опять же, чисто экономическом) смысле, входит в объект налогообложения.