Ну, на самом деле, я бы не сказал, что негативно повлияет: все страны ЕС проявили солидарность с Испанией - в Испании позиции сторонников интеграции сильнее некуда. Населению же стран ЕС как-то до лампочки, что там происходило в Каталонии - их отношение к ЕС не ухудшилось и не улучшилось из-за Каталонии
С Шотландией - да почти никак не соотносится: у шотландцев своя ситуация, которая на каталонскую не похожа почти ничем