Если ваш дом расположен в СНТ, то по СНИПам от красной линии проходит пятиметровая зона, свободная от строений со стороны улицы. Со стороны проездов дом должен быть расположен не ближе 3-х метров, поэтому, я считаю, что отказ в регистрации жилого дома правомерен