Вообще, если так происходит - это нехороший сигнал. Чтобы трафик шел из двух систем, нужно, как минимум, зарегистрировать компанию в обоих системах. Однако, перевес будет практически в любом случае ибо в одну, либо в другую сторону. Обусловлено это тем, что яндекс и гугл имеют разные, иногда взаимоисключающие требования для сайта для попадания в топ выдачи, так же яндексом в России пользуются большинство на компьютерах, а Google на смартфонах и планшетах. Под какой вид больше ориентирован сайт, там будет и больше переходов.