Дело в том, что зуб становиться мертвым, поддержки от организма у него нет, просто не живая кость зафиксированная в десне. Его перестает наполнять кальций.
Во время удаления нерва удаляются и кровеносные сосуды. Соответственно перестают поступать питательные вещества и минералы. С течением времени такой зуб теряет свой блеск. Так же причиной потемнения зуба после удаление нерва может быть использование окрашивающих материалов. Например - "резорцин-формалиновый метод"