Почему атеистам представляется, что верующие познают мир через религию, презрев науки?

Неосознанное незнание. Человек не понимает, что он что-то не знает. Человек думает, что он знает всё.

Осознанное незнание. Человек понимает, что он что-то не знает. Иллюзии знания у него уже нет.

Осознанное знание. Человек разобрался в вопросе, может разумно объяснить и эффективно действовать.

Неосознанное знание. Знание и умение перешли на уровень навыка или привычки. Действия стали автоматическими. Человек действует правильно и эффективно и не задумывается, как он это делает.

Наше высшее и отчасти среднее образование даёт вполне достаточно научных знаний, что б человек действовал эффективно на бытовом уровне (независимо от мировоззрения) - это осознанное и неосознанное знание. 

Когда же сложные вопросы мироздания, природы вещей начинают касаться  Осознанного незнания, вот тут и начинаются проблемы, это очень болезненное состояние для нашего разума, мозг не любит это состояние. И вот верующий считает, что бог подходит для перехода на уровень выше, а некоторым атеистам со стороны кажется, что  верующий перешел на уровень "Неосознанное незнание". 

Мое мнение надо уметь и заставлять себя принимать Осознанное незнание, сделать его альфой и омегой своего мировоззрения. Понимания актуального края науки нельзя постичь бытовым мышлением, нельзя заменять свои белые пятна мистическими (мифическими) фантазиями. 

Потому что подобные атеисты, те которые считают так как вы пишите в вопросе. Являются полными невеждами  не только в религии и поведении верующих, но порой и в науках.

Потому что атеисты как правило весьма необразованные люди, не имеющие (и не желающие иметь) ни какого представления не только о истинной религии и настоящих верующих, но и о науках к которым апеллируют.