Между σ - среднеквадратичным отклонением и σ² - дисперсией, при промежуточных вычислениях, нет принципиальной разницы. Одно из другого легко получается, но σ², часто, при промежуточных вычислениях удобнее.
В окончательных результатах используют σ (СКО) для оценок "одномерной" ошибки величины, типа, "приборы - 3,5±0,1" или "достоверность гипотезы - 5 сигм".
А σ² (дисперсию) используют в окончательных результатах, если её сравнивают с ковариациями для многомерных нормальных распределений, или сравнивают с квантилями распределения χ², и прочими статистическими критериями и изысками.