"Угу", так же как и "Да" имеют множество интонационных оттенков и являются признаком активного слушания. Это когда человек не перебивая дает высказаться другому, но при этом показывает свое участие и причастность к разговору. Очень действенный инструмент и в работе психолога, особенно в недирективных и психодинамических методиках. Позволяет лучше раскрыться человеку, если нужно сделать на чем то акцент в момент слушания, это можно отзеркалить или вернуть в форме открытого вопроса.
Конечно это может быть и признаком, того что человек просто видом показывает, что участвует в диалоге, но на самом деле его мысли далеко. Даже если перед вами и не профессиональный психолог, человек с привычкой "угу" характеризуется, как опытный собеседник, а присутсвует ли он полностью в разговоре, тут уже мимика и другие невербальные выражения в помощь.