Смотря для каких целей. Квартира - жилое помещение, Апартаменты- коммерческое помещение. Если с квартирой всем более менее ясно то апартаменты штука в нашей стране относительна свежая и не в всех городах развитая. Апартаменты развиты в Москве, Санкт-Петербурге и Сочи. Из основных отличий это не возможность прописаться (только временная регистрация) и разный налог на имущество физических лиц, если квартира это 0,1-0,3% от кадастровой стоимости то с апартаментов это уже до 2% в год.