Почему вы пишете, что растяжка не помогает, а в последнем пункте уже говорите, что нужна заминка с растяжкой?
Мне помогает растяжка.
Я выбрала для себя несколько упражнений из Хатха йоги для начинающих на разные группы мышц и делаю их всегда после пробежки. И дыхание помогает нормализовать и молочную кислоту разогнать.
Но если боли в мышцах постоянные и не прекращаются, то необходимо со специалистом проконсультироваться по поводу обуви, а так же технике бега.