Точно так же, как люди могут считать всех блондинок дурами, а всех темнокожих способными к баскетболу. Есть такое понятие, как стереотипы. Они прочно засели в культуре и, на самом деле, должны бы исполнять положительную функцию. Они позволяют человеку меньше анализировать других людей и меньше нагружать свой мозг и память этими ежедневными знакомствами. И в случает вещей, которые мы выбираем, стереотипы работают. То есть, если вы видите человека, который одет как панк, ведет себя как панк и говорит как панк, то и музыку он слушает скорее всего панковскую. И вам не нужно тратить время на то, чтобы уточнить это.
А вот с вещами типа расы, пола и возраста такие штуки работают куда хуже. Но так как механизм есть, его применяют и тут. Так получаются стереотипы о евреях. Часто довольно нелицеприятные. О их скупости или постоянной хитрости. Это уже заставляет людей их не любить.
Еще одно причиной ненависти к евреям может быть нелюбовь вообще ко всем другим. Та самая ксенофобия, о которой уже сказано в другом ответе. Сейчас вообще модно и одобряемо во многих частях нашего общества кричать: "Я русский".
Кроме того, само понятие евреев не особо ясное. То ли это раса, то ли религия. Живут везде, но и своя страна есть. Имеют довольно прочные связи внутри сообщества, помогают своим. Значит, точно не нашенские.
И вот эти две вещи: нелицеприятные стереотипы и ксенофобия - смешались с третьей. С необходимостью врага. Ведь если у нас в стране все плохо, то не можем же мы сами быть виноваты. Это жидомасонский заговор (они же хитрые, богатые и не из наших). Ну, в крайнем случае, рептилоидов.
До кучи можно еще вспомнить иудаизм и самоотношение к себе как к избранному народу (если я ничего не путаю), что тоже вызывает негатив. Можно вспомнить территориальные конфликты.
И все эти ситуации вместе и создают все это.