Конечно же, сетевая. Но цена ее гораздо выше автономной. За то высокая цена оправдывается необходимой функциональностью и гибкими возможностями. И здесь уже каждый решает сам, что для него лучше и приемлемее, исходя из назначения системы контроля доступа, и имея или нет возможность доплатить за функциональность.
Смотря для чего.
Если у вас большое предприятие, то, несомненно, лучше будет использовать сетевую.
Автономная проще и девешле, может использоваться без компа. Но она все-таки торопная: не выдает статистики, нельзя подготавливать отчеты, управлять дистанционно.