Какие литературные произведения, на ваш взгляд, самые глубокие и тяжёлые для понимания, если ты не имеешь религ. или фил. образований?

Стоит сказать о Достоевском. В произведениях "Бесы", "Братья Карамазовы" и "Преступление наказание" просматриваются евангельские образы. Соня читает Раскольникову о воскрешении Лазаря, а Братья Карамазовы начинаются эпиграфом, взятым из Евангелия от Иоанна.

Романы Достоевского основаны на христианском каноне, а именно: творение , грехопадение , воскресенье. В "Преступлении и наказании" основное внимание он уделил грехопадению и лишь дал намек на воскресение. Но даже только намек способствовал воплощению главной идеи романа.

Роман "Идиш" по теме православия. Трудно выделить более пронизанное христианской идеей произведение. 

В "Бесах" у Достоевского появился новый персонаж, священник Русской Православной церкви Тихон. Образ этот был списан со святителя Тихона Задонского, которого почитал писатель.

Из современного отмечу произведение : Гэнки Кавамура. "Если все кошки в мире исчезнут"

В своей книге японский писатель поднимает ряд важных тем и говорит о них устами персонажей. Автор предлагает задуматься читателю над вопросами, которые он задает прямым текстом: "Будет ли это непростительным преступлением, если я заставлю что-то исчезнуть из этого мира?" С помощью искусства слова знакомит современного читателя с христианской традицией, раскрывает для него незнакомый или малознакомый мир православной веры и культуры. Дьявол рассказывает содержание Книги Бытия о сотворении Богом земли за семь дней, про Адама и Еву, их грех и про само изгнание из Рая. А свое появление в жизни людей и главного героя непосредственно, объясняет так: "Спущусь на землю, помогу этим людям решить, что им на самом деле требуется, а что нет…» 

Сюда еще многое можно дописать, но получится целая работа по анализу многих достойных произведений. 

Также сюда хочется добавить Умберто Эко "Имя розы"

Эко говорит о семиотике как новой форме культурной антропологии, социологии, критики идей и эстетики. Четырнадцатый век представляет собой поистине уникальную эпоху, поскольку мышление этого времени насквозь пронизано символами и знаками. Каждый поступок человека воспринимается в двух планах – практическом и символическом. В средневековые времена мир представляет собой огромную книгу, смысл которой раскрывается через систему божественных символов.

Такие, где упоминаются философия и религия, соответственно. К примеру, «Война И Мир» Льва Толстого; «Последнее искушение Христа» Никос Казандзакис; «Мастер и Маргарита» Булгаков; «Фауст» Гёте; «Дракула» Брем Стокер; произведения такого великого мистика, как Эдгар Алан По…