Ответ на ваш вопрос всегда будет субъективный, т.к. каждый специалист выбирает для себя индивидуальные параметры, по которым он ориентируется при продвижении веб-проекта. Так же есть понятие "удобство", и что удобно одному, неудобно для другого.
Функционал в обоих инструментах +/- одинаковый и дает возможность получить необходимую (минимальную) информацию.
Но если ориентироваться на RU сегмент, и то, что основная доля трафика на русскоязычные проекты, как правило, идет с поисковой системы Яндекс, то логично использовать инструмент, который "заточен" по соответствующую поисковую систему и рынок.