Я считаю, что нужно взять за основу Японские школы. В них все сделано максимально под занятости учеников. Но самый лучший вариант был предложен выше в комментариях. Разделение школ на 3 группы будет комфортне для всех.
Я считаю, что лучше делать интерьеры максимально домашними, с теплыми полами, и без обуви внутри вообще. Плюс нужно больше мест на свежем воздухе. Удлинить перемены и позволять детям гулять на территории круглогодично, одевая одежду и обувь. Например, 1 час на обед можно провести на улице, покушав за 15 минут и погуляв 45 минут. Пусть общаются.
Большое спасибо, полезная информация, обязательно использую для проекта.