Мы так не считаем. Мы не считаем. что Бога не существует. Мы считаем, что Бога пока не нашли. То есть в практическом, жизненном смысле это то же самое, что его и нет. Ну а в научном строгом смысле - пока не нашли. И всё.
Это всё равно предположение или точнее вероятность хоть и стремится к 100% правоте
Это учёные, а не атеисты (причём учёные-верующие). А у вас какой-то живой труп получился.
Почему атеисты считают, что Бога не существует - можно ли это считать только предположением с их стороны
Можно это считать предположением, также как можно считать предположением о том, что Бог существует. Раз нет строгих доказательств, то всё предположения. Поэтому следует оставить пустые споры и изучать мир, пытаясь найти правдивые ответы на его устройство.