Можно ли сказать, что религия делает человека плохим, эгоистом, потому что он делает добро, исходя из мысли попасть в Рай?

Плохим человека делает иллюзия непосредственного альтруизма. Потому что он считает свои намерение добрыми, и пытается их безупречно реализовать. А его — "наказывают". Чем он безупречнее — тем хуже. Он злится. И начинает считать злыми и/или неблагодарными других. Пытается делить их на заслуживающих и незаслуживающих его добра; но в итоге (как правило) оказывается, что не заслуживает практически никто...

Поэтому он либо становится слабым (то есть старается оставаться добрым, но у него плохо получается) — и тогда к нему часто относятся снисходительно: он как бы добрый ребёнок, ничего страшного, в сущности милый, всех любит, просто не везёт... — либо ожесточается. Странным образом это может соседствовать с сентиментальностью. И тоже слабостью, во многих ситуациях. Может обвинять родителей, что они неправильно (слишком добрым) его воспитали, но в то же время боготворить их. С нежностью относиться к людям, которым на него практически наплевать, но считать мир полным зла. Бороться ради "семьи" или (как он думает) близких людей с ненавистным уже ему обществом. Которое его обманывает и обирает; поэтому он тоже.

Религия (именно концепцией Рая) для многих исправляет эту позицию.

Здравствуйте. Религия религии рознь. Если в своем вопросе Вы имели ввиду христианство, то непонятно, с чего Вы взяли, что христиане делают добро из меркантильных целей? Это примитивная религиозность, свойственная, скорее, язычникам (задабривание божков). Христианство не имеет целью сделать человека плохим, эгоистом. Его цель диаметрально противоположна.