Грубо говоря, пилатес - это та же йога без "духовного наполнения". Йога - это все же не просто набор физических упражнений, это особая философия и мировоззрение. Быть йогином - это особый путь, и духовный, и физический, и психологический. Не все к этому готовы и не все воспринимают йогу всерьез, но тем не менее, это так.
А пилатес - это именно набор физических упражнений, которые развивают гибкость и координацию. Пилатесом может заниматься каждый, не заморачиваясь духовной "начинкой", ее там просто нет.
Эти два напарвления в чем-то схожи, но отличий явно больше! Мы же не сравниваем мотоцикл и машину. Да, и то и другое - транспортные средства и служат они для целей передвижения, но идея, управление и внешний вид у них- координально отличется! так и здесь! Мы в свое время писали статью на эту тему. Рекомендую к прочтению!